基因组测序被简化
近日,英国研究人员将基因组测序的标准流程简化,无需进行文库制备且只要很少量的DNA就能获得序列数据,完成DNA(脱氧核糖核酸)单分子测序,用量可低至不到1纳克(10亿分之一克),仅为常规测序方法的500分之一到600分之一。
论文作者、英国威康信托基金会桑格研究所的保罗·库普兰说:“我们用这种方法对病毒和细菌的基因组测序后发现,即使在相对较低的水平,我们也能够确定所检测的是何种有机物,不论样本中是否存在特定的基因或质粒,或者其他信息,如对特定DNA碱基的修改等。”
威康信托基金会桑格研究所的哈罗德·斯维尔德洛说:“我们的技术可以在对所测序列没有任何先验知识、没有特定微生物试剂的条件下,在很短的时间内操作,这是一种很有前途的替代手段,可应用于控制感染等临床需要。”
通过利用第三代单分子测序系统PacBio RS演示了这种简化的直接测序方法,事实证明,仅仅用800皮克(千分之一纳克)DNA来分析一个生物体的基因组,尽管测序仪只读取了基因组的70个序列片段,相对于常规测序方法获得的数据来说不过是很小的一部分,但这些信息足以让研究人员确定生物体的品种。
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